1つ目は緑色素はクロロフィルaと呼ばれる葉緑素です。体を内側からキレイにする働きがあります。そして化学構造が血液中のヘモグロビンに似ているので別名を緑の血液ともいいます。
2つ目は、橙黄色素のカロテノイド系色素のβ-カロテン、ゼアキサンチンです。体内でビタミンAに変化するもので、にんじんやほうれん草に多く含まれることで知られています。
最後は、青色素のフィコシアニンで、人体の胆汁色素と全く同じもので、クロレラには含まれない色素です。

藻の仲間であるスピルリナは植物ですが、たんぱく質のアミノ酸組成はどちらかといえば動物的で、FAO（世界農業食料機構）の定める必須アミノ酸組成の理想基準を大きく上回ります。

なお、『日本食品標準成分表』の五訂にはWHO（世界保健機関）、FAO（世界農業食料機構）、UNU（国際連合大学）によって発表された食品中の必須アミノ酸の含有比率を評価するための数値＝アミノ酸スコアが採用されています。

β-カロテンや鉄、カルシウムなどのミネラル、アミノ酸、葉酸、食物繊維などが多く、人体内で作ることができない必須アミノ酸を全て含む良質なタンパク質が豊富に含まれています。
β-カロテンはほうれん草の約40倍も含まれています。
食物繊維は約3.8％で、その約4割以上は水溶性難消化性多糖です。

またビタミン、ミネラルが豊富で良質なたんぱく質も多いレバーに匹敵する程のビタミン・ミネラル・良質なタンパク質を含みます。特にビタミンB12が豊富です。
海草に多いヨードは含まれないので、ヨード制限をされている方もお召し上がりいただけます。

藻類は色あいによって藍藻、緑藻、褐藻、紅藻に分類されますが、藍藻類であるスピルリナはリノール酸、アラキドン酸とともに多価不飽和脂肪酸の一種であるといわれているγ-リノレン酸が約1.0％と他の藻類と比較しても多く含まれています。
そもそもリノレン酸はαとγの2タイプがあり、植物はαタイプ・動物はγタイプとされています。
しかし不思議なことにスピルリナは植物であるのに関わらずγ-リノレン酸を沢山含んでいるのです。
なお、不飽和脂肪酸は青魚に多く含まれる動物性脂肪で人間の初乳にも多く含まれています。

細胞壁が薄く壊れやすいため、消化吸収率が良いので成分を利用しやすい特徴があります。
スピルリナにはビタミン・ミネラル・タンパク質の他、動物デンプンと呼ばれるグリコーゲンがあります。光合成をしてデンプンを作るのではなくグリコーゲンを作り出すのです。
人間もエネルギーを発生する際にグリコーゲンを合成するのですが、スピルリナを摂取すればブドウ糖から合成することなく、即エネルギーとして蓄えることができるのです。